Παρουσίαση/Προβολή

(BIOL213) -  Αικατερίνη-Μαρία Παππά, Βασίλειος Κουβέλης

Περιγραφή Μαθήματος

• Μοριακοί μηχανισμοί δημιουργίας και επιδιόρθωσης μεταλλαγών. Bλάβες του DNA: Μηχανισμοί δημιουργίας αυτόματων μεταλλαγών, ρόλος των DNA πολυμερασών, αποπουρίνωση-αποπυριμιδίνωση, περιβαλλοντικοί μεταλλαξoγόνοι παράγοντες. Μοριακοί μηχανισμοί επιδιόρθωσης βλαβών του DNA: Χημικοί μεταλλαξoγόνοι παράγοντες, φωτοεπιδιόρθωση, επιδιόρθωση βλαβών από αλκυλιωτικούς παράγοντες, ρόλος γλυκοζυλασών, ρόλος ΑΡ-ενδονουκλεασών, μηχανισμοί εκτομής βλαβών, επιδιόρθωση μέσω γενετικού ανασυνδυασμού, επιδιόρθωση μέσω του συστήματος SOS.
• Μεταθετά στοιχεία. Προκαρυωτικά και ευκαρυωτικά μεταθετά στοιχεία, μοριακοί μηχανισμοί μετάθεσης, ρύθμιση της μετάθεσης, ο ρόλος των μεταθετών στοιχείων στις γονιδιωματικές ανακατατάξεις, Τn5-Τn10-Μu ως παραδείγματα προκαρυωτικών μεταθετών στοιχείων, μεταθετά στοιχεία καλαμποκιού και δροσόφιλας ως παραδείγματα ευκαρυωτικών συστημάτων, ρετροϊοί  και ρετροτρανσπόζονς, αλληλουχίες LINE και SINE.
• Εξωχρωμοσωμική κληρονομικότητα σε μικροοργανισμούς και φυτά, χλωροπλαστικό και μιτοχονδριακό DNA. Μέθοδοι εντοπισμού εξωχρωμοσωμικής κληρονομικότητας, μητρική επίδραση, δημιουργία και απομόνωση μιτοχονδριακών ή/και χλωροπλαστικών μεταλλαγών, δομή-λειτουργία-οργάνωση mtDNA και ctDNA γονιδιωμάτων, χαρτογράφηση κυκλικών γονιδιωμάτων, φυσικά συστήματα γενετικού ανασυνδυασμού mtDNA μικροοργανισμών, χρησιμότητα mtDNA σε πληθυσμιακές μελέτες, μοριακή ταυτοποίηση (RFLPs) και φυλογένεση με χρήση γονιδίων του mtDNA ή ολόκληρων γονιδιωμάτων, θεωρίες ενδοσυμβίωσης.
• Μετασχηματισμός. Κινητική βακτηριακού μετασχηματισμού, δεκτικότητα κυττάρων, τύχη του DNA κατά τον μετασχηματισμό, μοριακοί μηχανισμοί μετασχηματισμού, μετασχηματισμός μυκήτων, γενετική χαρτογράφηση μέσω μετασχηματισμού.
• Σύζευξη – Πλασμίδια.  Σύζευξη στο βακτήριο Escherichia coli, το παράδειγμα και η ιστορία του πλασμιδίου F, τα στελέχη F⁺, F^-, F’ και Hfr. Μοριακοί μηχανισμοί της μεταφοράς DNA μέσω σύζευξης. Ρόλος πλασμιδίων, τύποι πλασμιδίων, ομοιότητες και διαφορές στη δομή και οργάνωση των πλασμιδίων, συζευκτική ασυμβατότητα. Καταβολικά πλασμίδια, R-τύπου πλασμίδια, καταστολή-αποκαταστολή συζευκτικότητας, επιβοηθούμενη σύζευξη, χαρτογράφηση γενετικού υλικού, κατασκευή-βελτίωση στελεχών. Φαινόμενα οριζόντιας μεταφοράς ανάμεσα σε βασίλεια οργανισμών.
• Μεταγωγή. Μεταγωγικοί φάγοι, γενικευμένη-εξειδικευμένη-εκτρωτική μεταγωγή, το παράδειγμα του φάγου λ, δομή-λειτουργία-οργάνωση του φάγου λ, η γενετική βάση της λυσιγονίας, μοριακοί μηχανισμοί ανοσίας σε μόλυνση φάγων, χαρτογράφηση με τη βοήθεια φάγων, ρόλος των βοηθητικών φάγων λ, είσοδος φάγων στο χρωμοσωμικό υλικό του ξενιστή και διακοπή λειτουργίας γονιδίων, κατασκευή-βελτίωση στελεχών.
• Δημιουργία και σύντηξη πρωτοπλαστών. Ενζυμική απομάκρυνση κυτταρικών τοιχωμάτων μικροοργανισμών, επαγόμενη σύντηξη πρωτοπλαστών, ηλεκτροδιάτρηση.
• Γενετική Μηχανική. Απομόνωση DNA από κύτταρα ευκαρυωτικών και προκαρυωτικών οργανισμών, απομόνωση πλασμιδιακού, φαγικού και ιϊκού DNA. Τροποποιητικά ένζυμα, περιοριστικές ενδονουκλεάσες-πέψη DNA-χαρτογράφηση. Κλωνοποίηση–έκφραση γονιδίων. Δημιουργία γονιδιακών βιβλιοθηκών σε πλασμίδια, φάγους, κοσμίδια, ΒΑCs, YACs. Κατασκευή cDNA βιβλιοθηκών. Άμεση και έμμεση επιλογή γονιδιωματικών κλώνων. Χρήση τεχνολογιών ιχνηθέτησης, αλληλούχησης, PCR. Δημιουργία μικροβιακών στελεχών με επιλεγμένες ιδιότητες. Σύγχρονες εφαρμογές: μεμονωμένη ή μαζική μελέτη έκφρασης γονιδίων, μεταλλαξογένεση ειδικής θέσης, γονιδιακή αντικατάσταση ή απαλοιφή, διαγονιδιακή τεχνολογία, γονιδιωματική έρευνα.

Ημερομηνία δημιουργίας

Δευτέρα 24 Ιανουαρίου 2011