Algorithms in Structural Bioinformatics - Aλγόριθμοι στη Δομική Βιοπληροφορική (Μ103)

Ioannis Emiris - Evangelia Chrysina

Description

Starting in Spring 2019, the course is taught in English. This site shall be updated to include a course description in English.

Εισαγωγή στα είδη, την αναγνώριση και τον προσδιορισμό της δευτεροταγούς και της τριτοταγούς δομής μορίων και, ειδικότερα, πρωτεϊνών. Πειραματικά δεδομένα Μαγνητικής Αντήχησης Πυρήνων (Nuclear Magnetic Resonance) και κρυσταλλογραφίας ακτίνων Χ. Μοντελοποίηση του προβλήματος προσδιορισμού της αναδίπλωσης πρωτεϊνών και του εντοπισμού φαρμακοφόρων περιοχών.

Ακολουθίες, σύγκριση και στοίχιση ακολουθιών, στοίχιση με κενά. Δυναμικός προγραμματισμός. Εφαρμογή στην δευτεροταγή δομή RNA. Σύγκριση, υπέρθεση και στοίχιση τρισδιάστατων δομών. Γεωμετρικός κατακερματισμός (geometric hashing).

Γεωμετρία των αποστάσεων, άκαμπτοι γράφοι και υπολογισμός μοριακών διαμορφώσεων μέσω πινάκων αποστάσεων. Κινηματική των μορίων και πίνακες μετασχηματισμών για την περιγραφή διαμορφώσεων στερεών σωμάτων με δεδομένους βαθμούς ελευθερίας. Αναζήτηση στον χώρο των διαμορφώσεων (Comformation

More  
Course code: ΤΠΙΒ ΥπΒ 8
Faculty: Informatics and Telecommunications » Postgraduate courses » Information Technologies in Medicine and Biology
Informatics and Telecommunications » Postgraduate courses » Computer Science » 1 - Computer Science Foundations and Applications
Informatics and Telecommunications » Postgraduate courses » Computer Science » 2 - Data, Information and Knowledge Management
Informatics and Telecommunications » Postgraduate courses » Computer Science » 3- Computer Systems: Software and Hardware
Informatics and Telecommunications » Postgraduate courses » Data Science and Information Technologies » 2 - Bioinformatics – Biomedical Data Science
Informatics and Telecommunications » Postgraduate courses » Algorithms, Logic, and Discrete Mathematics » 1 - Algorithms and Computational Complexity
Informatics and Telecommunications » Postgraduate courses » Algorithms, Logic, and Discrete Mathematics » 2 - Mathematical and Computational Logic
Informatics and Telecommunications » Postgraduate courses » Algorithms, Logic, and Discrete Mathematics » 3 - Discrete Mathematics

Calendar